Num Japão repleto de Kaiju, Kafka Hibino trabalha na eliminação de monstros. Depois de se reencontrar com a sua amiga de infância Mina Ashiro, uma estrela em ascensão na Força de Defesa anti-Kaiju, decide perseguir o sonho que tinha abandonado de se alistar na Força, quando, de repente, se transforma no poderoso «Kaiju n.º 8». Com a ajuda do seu colega mais novo, Reno Ichikawa, Kafka esconde a sua identidade enquanto luta para realizar o sonho de toda a sua vida: passar no exame da Força de Defesa e ficar ao lado de Mina. Mas quando misteriosos Kaiju inteligentes atacam uma base da Força de Defesa, Kafka enfrenta uma decisão crucial numa situação desesperada.